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| 東征大総督府 | 大総督 | 有栖川宮熾仁親王 | ||||||||
| 上参謀 | 正親町中将 | |||||||||
| 西四辻大夫 | ||||||||||
| 下参謀 | 西郷吉之助 | |||||||||
| 林玖十郎 | ||||||||||
| 錦旗奉行 | 穂波三位 | |||||||||
| 河鰭大夫 | ||||||||||
| 錦旗持手 | 平岡掃部権助 以下１２名 | |||||||||
| 奥羽鎮撫使総督府 | 総督 | 九条道孝 | ||||||||
| 副総督 | 沢三位為景 | |||||||||
| 上参謀 | 醍醐少将忠敬 | |||||||||
| 下参謀 | 大山格之助 世良修蔵 |
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| 北陸道鎮撫総督府 | 総督 | 高倉三位（永祐） | ||||||||
| 副総督 | 四条大夫（隆平） | |||||||||
| 参謀 | 津田信弘 小林柔吉 ４月より 黒田了介 山県狂介 時山直八 |
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| 東山道鎮撫総督府 | 総督 | 岩倉大夫（具定） | ||||||||
| 副総督 | 岩倉八千丸（具綱） | |||||||||
| 参謀 | 宇田栗園 板垣退助 伊地知正治 |
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| 東海道鎮撫総督府 | 総督 | 橋本少将（実梁） | ||||||||
| 副総督 | 柳原侍従（前光） | |||||||||
| 参謀 | 木梨精一郎 | |||||||||
| 海江田信義 | ||||||||||
| 海軍総督府 | 総督 | 大原侍従（俊実） | ||||||||
| 参謀 | 伊東外記 増田左馬助 |
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